LabDAO Sedang Mencarta Masa Depan AI Sumber Terbuka Untuk Penemuan Dadah

Projek Folding@home menjadi tajuk utama sepanjang pandemik COVID-19 kerana menyusun kuasa pengkomputeran yang tidak digunakan untuk meneroka ruang carian lipatan protein untuk menangani novel coronavirus. Memperkasakan rakyat untuk menjadi saintis dengan hak mereka sendiri, inisiatif ini menjalankan simulasi berskala besar bagi konfigurasi molekul protein yang berbeza merentasi rangkaian pengedaran komputer "berdaftar" di seluruh dunia.

Paradigma terdesentralisasi ini digembar-gemburkan untuk menyatukan orang ramai mengenai masalah biasa dan kuasa pengkomputeran sumber ramai dengan cekap, tetapi bagaimana jika kuasa pengkomputeran dan infrastruktur penyelesaian masalah disongsangkan? Dalam erti kata lain, bagaimana jika individu boleh menjalankan projek mereka sendiri dengan memanfaatkan kuasa pengkomputeran terkumpul and alat untuk eksperimen biologi untuk boot?

LabDAO menjadikan impian itu satu kenyataan dengan Platform PLEXnya. PLEX ialah alat baris arahan sumber terbuka yang direka untuk menjadikan bukan sahaja sumber pengkomputeran tetapi juga pelbagai alatan pembelajaran mesin biologi (yang diciptakan suite "BioML" dalam LabDAO) boleh diakses merentasi pelbagai latar belakang. Sama ada bereksperimen dengan dok molekul kecil atau simulasi lipatan protein sendiri, PLEX membenarkan pengguna memanfaatkan perpustakaan alatan LabDAO, berkongsi hasil dan memvisualisasikannya dalam masa kurang daripada lima minit.

Set alatan dan platform yang membolehkan penggunaannya di atasnya telah dipamerkan di sidang kemuncak Blockchain Meets Biology Zuzalu pada awal April, di mana ahli Pasukan Teras LabDAO, Lily Hansen-Gillis menunjukkan dari awal hingga akhir simulasi dinamik molekul dalaman protein untuk mencari konfigurasi yang paling stabil. Kemudian, sebagai "bukan pengekod" yang mengaku dirinya sendiri, dia membimbing penonton melaluinya dari awal hingga akhir—semuanya dengan komputer, WiFi, PLEX pada baris arahan dan tidak lebih.

Secara lebih luas, LabDAO ialah platform terdesentralisasi yang didayakan web3 (sebahagian daripada pergerakan "DeSci" yang lebih besar) yang komited untuk mewujudkan persekitaran yang lebih produktif untuk penemuan ubat berkuasa sumber terbuka. Dengan menyediakan alatan dan sumber yang canggih kepada ekosistem yang lebih luas, LabDAO menyasarkan untuk mewujudkan persekitaran yang sesuai untuk kemajuan saintifik yang telus dan boleh diakses. Sama ada dengan menghapuskan keperluan untuk penyelidik mempunyai perkakasan atau infrastruktur pengkomputeran mereka sendiri atau menerbitkan hasil eksperimen pada lejar blockchain supaya ia boleh dikesan dan boleh diterbitkan semula, organisasi komited untuk menjadikan lebih banyak inovasi boleh dilakukan melalui kerjasama — memecahkan halangan yang disebabkan oleh kelemahan kebolehgunaan dan siloed, kepakaran khusus.

Usaha LabDAO untuk membina dunia DeSci masa depan untuk hari ini baru-baru ini menerima rangsangan dalam bentuk pusingan pembiayaan $3.6 juta daripada pelbagai DAO lain, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan dan lain-lain. Kemasukan sokongan ini akan menyumbang kepada usaha berterusan untuk membina alat perisian sumber terbuka dan memperkukuh ekosistem penyelidikan LabDAO.

Bagi PLEX sendiri, langkah seterusnya yang segera di ufuk termasuk menguji platform dalam kerjasama saintifik yang berbeza, menyimpan pelbagai alatan dan mengumpul perkakasan yang diperlukan untuk memupuk rangkaian BioML.

Bagi jangka panjang, mungkin ubat menyelamatkan nyawa seterusnya semasa wabak penyakit berjangkit utama seterusnya akan direka bentuk dengan kuasa PLEX, satu langkah terdesentralisasi ke hadapan pada satu masa. Apabila ekosistem terus berkembang, hanya masa yang akan menentukan.

Terima kasih kepada Aishani Aatresh untuk penyelidikan dan pelaporan tambahan mengenai artikel ini. Saya ialah pengasas SynBioBeta, dan beberapa syarikat yang saya tulis adalah penaja kepada Persidangan SynBioBeta. Untuk lebih banyak kandungan, anda boleh melanggan surat berita mingguan saya.

Sumber: https://www.forbes.com/sites/johncumbers/2023/06/02/labdao-is-charting-the-future-of-open-source-ai-for-drug-discovery/